Por unanimidad, el Pleno aprobó la conformación de las 35 comisiones legislativas y los cinco comités permanentes de la 60 Legislatura mexiquense, cuyas presidencias serán: para morena 20; PRI, PT y PAN, cinco cada uno; Encuentro Social, tres; PVEM, una; y PRD, una.
Las comisiones se integrarán cuando menos por nueve diputados. Para su organización interna cada una de ellas contará con un presidente, un secretario y un prosecretario; sus resoluciones se tomarán por mayoría de votos y, en caso de empate, quien presida tendrá voto de calidad. Estos órganos colegiados contarán con un secretario técnico designado por su presidente.
Por otro lado, de acuerdo con la reglamentación, los comités permanentes solo podrán emitir opiniones, proposiciones, informes y recomendaciones de los asuntos que les sean encomendados. Las comisiones y los comités serán instalados entre el miércoles 26 de septiembre y el martes 2 de octubre del año en curso.
A continuación, se enlistan las comisiones legislativas y los comités permanentes conforme lo establece la Ley Orgánica del Poder Legislativo, con los nombres de los diputados y grupos parlamentarios que las presidirán:
| Comisión | Presidente | Grupo Parlamentario |
| Gobernación y Puntos Constitucionales | María Mercedes Colín Guadarrama | PRI |
| Legislación y Administración Municipal | María Luisa Mendoza Mondragón | PVEM |
| Procuración y Administración de Justicia | Sergio García Sosa | PT |
| Planeación y Gasto Público | Adrián Manuel Galicia Salceda | morena |
| Trabajo, Previsión y Seguridad Social | Luis Antonio Guadarrama Sánchez | PT |
| Educación, Cultura, Ciencia y Tecnología | Benigno Martínez García | morena |
| Desarrollo Urbano | José Antonio García García | PAN |
| Planificación Demográfica | Violeta Nova Gómez | morena |
| Desarrollo Agropecuario y Forestal | Margarito González Morales | morena |
| Protección Ambiental | María de Lourdes Garay Casillas | PES |
| Desarrollo Económico, Industrial, Comercial y Minero | Alfredo González González | morena |
| Comunicaciones y Transportes | Nazario Gutiérrez Martínez | morena |
| Derechos Humanos | Julio Alfonso Hernández Ramírez | morena |
| Salud, Asistencia y Bienestar Social | Berenice Medrano Rosas | morena |
| Seguridad Pública y Tránsito | Liliana Gollas Trejo | morena |
| Electoral y de Desarrollo Democrático | Juan Jaffet Millán Márquez | PRI |
| Patrimonio Estatal y Municipal | Marlon Martínez Martínez | PRI |
| Desarrollo Turístico y Artesanal | María del Rosario Elizalde Vázquez | morena |
| Asuntos Metropolitanos | Juan Carlos Soto Ibarra | PES |
| Vigilancia del Órgano Superior de Fiscalización | Tanech Sánchez Ángeles | morena |
| Asuntos Indígenas | Juliana Felipa Arias Calderón | PES |
| Protección Civil | Max Agustín Correa Hernández | morena |
| Atención de Grupos Vulnerables | Alicia Mercado Moreno | morena |
| Desarrollo y Apoyo Social | Edgar Armando Olvera Higuera | PAN |
| Límites Territoriales del Estado de México y sus Municipios | Juan Pablo Villagómez Sánchez | morena |
| Igualdad de Género | Guadalupe Mariana Uribe Bernal | morena |
| Seguimiento de la Operación de Proyectos para la Prestación de Servicios | Julieta Villalpando Riquelme | PT |
| Juventud y el Deporte | Monserrat Ruíz Páez | morena |
| Finanzas Públicas | Francisco Rodolfo Solorza Luna | PT |
| Recursos Hidráulicos | Dionicio Jorge García Sánchez | morena |
| Apoyo y Atención al Migrante | Karla Leticia Fiesco García | PAN |
| Participación Ciudadana | María Lorena Marín Moreno | PRI |
| Asuntos Internacionales | Reneé Alfonso Rodríguez Yánez | PAN |
| Transparencia, Acceso a la Información Pública, Protección de Datos Personales y de Combate a la Corrupción | Brenda Escamilla Sámano | PAN |
| Familia y Desarrollo Humano | Araceli Casasola Salazar | PRD |
| Comités | Presidente | Grupo parlamentario |
| Administración | Valentín González Bautista | morena |
| Estudios Legislativos | Armando Bautista Gómez | PT |
| Comunicación Social | Anaís Miriam Burgos Hernández | morena |
| Vigilancia de la Contraloría | Iveth Bernal Casique | PRI |
| Editorial y de Biblioteca | Xóchitl Flores Jiménez | morena |
